RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 DECR2Q9NUI1 292 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 CACNG2Q9Y698 323 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 METTL15A6NJ78 407 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 MLNRO43193 412 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 KRT8P05787 483 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 PSMB10P40306 273 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDLIM4P50479 330 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 IL18R1Q13478 541 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 LIPNQ5VXI9 398 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF786Q8N393 782 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SP140LQ9H930 580 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM100Q9NV29 134 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 GNG8Q9UK08 70 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 R4GMQ9 66 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADH4P08319 380 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD99P14209 185 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SELEP16581 610 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 CA6P23280 308 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCTDP32321 178 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 GSK3AP49840 483 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 MMP16P51512 607 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR12D2P58182 307 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF649Q9BS31 505 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 REG4Q9BYZ8 158 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 DLL4Q9NR61 685 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 F5H5P2 479 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 H0YJX3 145 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SULT1C4O75897 302 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACKR3P25106 362 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAB40BQ12829 278 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ODF4Q2M2E3 257 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM209AQ5JX71 171 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 RORBQ92753 470 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 RDH5Q92781 318 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 MED13LQ71F56 2210 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZANQ9Y493 2812 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 J3QLW9 94 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 XPNPEP2O43895 674 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM20BO75063 409 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGHA1P01876 353 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTRP02766 147 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD55P08174 381 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF19P17023 458 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 DSCR9P59020 149 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACTC1P68032 377 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACTA1P68133 377 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 MVKQ03426 396 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDONQ4KMG0 1287 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLHL22Q53GT1 634 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 GGHQ92820 318 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2V2Q96R30 315 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 DIRC2Q96SL1 478 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMR3AQ99954 134 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ALG8Q9BVK2 526 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPR84Q9NQS5 396 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms