RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MRAPQ8TCY5 172 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 HAVCR1Q96D42 359 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 PYURFQ96I23 114 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 C8orf49Q96NF6 230 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 OR8B2Q96RD0 313 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 C16orf95Q9H693 158 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 WDR76Q9H967 626 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 POLE4Q9NR33 117 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MIOXQ9UGB7 285 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.51□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 C5orf63A6NC05 138 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 OR6C6A6NF89 314 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ZNF879B4DU55 563 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 FFAR1O14842 300 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 GSTA4O15217 222 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 FAM20BO75063 409 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MT-ND1P03886 318 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 SLPIP03973 132 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 HLA-DPB1P04440 258 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 GSTM3P21266 225 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MSR1P21757 451 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 TNFSF4P23510 183 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MAGEA2P43356 314 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 COX10Q12887 443 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 KLRD1Q13241 179 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MAB21L1Q13394 359 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 RIPK1Q13546 671 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MPPED2Q15777 294 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 PNKDQ8N490 385 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 LHX4Q969G2 390 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 FAM162AQ96A26 154 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 WDFY2Q96P53 400 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 TECTBQ96PL2 329 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 S100A14Q9HCY8 104 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 VNN3Q9NY84 501 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 CLN8Q9UBY8 286 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.5□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 DHRS12A0PJE2 317 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 P2RY10O00398 339 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 CIB2O75838 187 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 TSPAN9O75954 239 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 TOX4O94842 621 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 CTLA4P16410 223 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 OR1E2P47887 323 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ARHGDIAP52565 204 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MESTQ5EB52 335 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ARL9Q6T311 187 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 SPATA24Q86W54 205 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 OR8G5Q8NG78 346 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 C17orf50Q8WW18 174 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 LIPHQ8WWY8 451 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 PHF21AQ96BD5 680 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 SGTBQ96EQ0 304 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MPP4Q96JB8 637 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 FUZQ9BT04 418 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 ALG12Q9BV10 488 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 CHID1Q9BWS9 393 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.49□□□□□ -1.37
RD3L-201ENST00000557640 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms