RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556164.5

PRKCH-220, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 3

Gene PRKCH, Length 429 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-220	ENST00000556164	UBD	O15205	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	MGRN1	O60291	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SERPINB7	O75635	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	NGF	P01138	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	OPN1SW	P03999	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	KRT8	P05787	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	LYL1	P12980	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ACADS	P16219	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	POU1F1	P28069	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	VSNL1	P62760	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	GNB2	P62879	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	PSG4	Q00888	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	FMOD	Q06828	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	CD47	Q08722	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SGCA	Q16586	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	NSMAF	Q92636	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	CITED1	Q99966	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	NDUFA7	O95182	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	LYPD3	O95274	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	TSPAN15	O95858	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	THY1	P04216	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	THRB	P10828	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	GSTM3	P21266	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	UGT2B15	P54855	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	PSG7	Q13046	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	NPTX1	Q15818	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ARL9	Q6T311	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCH-220	ENST00000556164	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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