RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM221A	A4D161	298 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	P2RY10	O00398	339 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ZFPL1	O95159	310 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CLPTM1	O96005	669 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ISG15	P05161	165 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF250	P15622	560 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ACHE	P22303	614 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	DDOST	P39656	456 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	KIR3DL2	P43630	455 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	MAP2K3	P46734	347 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	XAF1	Q6GPH4	301 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	MUC15	Q8N387	334 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	NEUROG1	Q92886	237 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CMBL	Q96DG6	245 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	HHLA2	Q9UM44	414 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	EDAR	Q9UNE0	448 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	C5orf63	A6NC05	138 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904		B9A039	149 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	OGG1	O15527	345 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	PLPP2	O43688	288 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	DHRS3	O75911	302 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	LALBA	P00709	142 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF20	P17024	532 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	PCMT1	P22061	227 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	TTK	P33981	857 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	GNAL	P38405	381 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	LIPA	P38571	399 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	MPV17	P39210	176 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	EVX1	P49640	407 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	GSK3A	P49840	483 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM3A	P98173	230 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR50	Q13585	617 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	TRAM1	Q15629	374 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF611	Q8N823	705 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR148	Q8TDV2	347 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	THRSP	Q92748	146 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	GHSR	Q92847	366 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	POFUT1	Q9H488	388 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	SCOC	Q9UIL1	159 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	DHDH	Q9UQ10	334 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CD300LB	A8K4G0	201 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904		M0R233	179 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CCRL2	O00421	344 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	SERPINA3	P01011	423 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CD1A	P06126	327 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CD2	P06729	351 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	OCM2	P0CE71	109 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CPE	P16870	476 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CD53	P19397	219 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	KITLG	P21583	273 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	CCL1	P22362	96 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	PSG7	Q13046	419 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	OR8B8	Q15620	311 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	EFNB3	Q15768	340 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	RDH10	Q8IZV5	341 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	OR5AS1	Q8N127	324 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ABCD4-223	ENST00000555904	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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