RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 PSMD7P51665 324 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TMBIM6P55061 237 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 BSPH1Q075Z2 132 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SLC3A1Q07837 685 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MZT1Q08AG7 82 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CDSNQ15517 529 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SLC22A25Q6T423 547 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 KRT74Q7RTS7 529 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 OR51E1Q8TCB6 317 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PP6455Q8WZ26 134 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SGK3Q96BR1 496 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 YIPF6Q96EC8 236 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 REEP6Q96HR9 211 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SLITRK2Q9H156 845 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GPR84Q9NQS5 396 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MEGF11A6BM72 1044 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GGT3PA6NGU5 568 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 AIREO43918 545 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TMEM127O75204 238 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ALX3O95076 343 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SLC2A1P11166 492 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 BMP4P12644 408 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CCL2P13500 99 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF250P15622 560 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF20P17024 532 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 KITLGP21583 273 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GNALP38405 381 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 WNT5AP41221 380 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 OR8B8Q15620 311 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 NAA40Q86UY6 237 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TPRA1Q86W33 373 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SPERTQ8NA61 448 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 PIGTQ969N2 578 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 HAVCR1Q96D42 359 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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CS-220ENST00000550700 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TMED9Q9BVK6 235 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 STARD10Q9Y365 291 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 CMAHPQ9Y471 501 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 V9GYS6 101 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 LRRK2Q5S007 2527 aa8.02□□□□□ -1.12
CS-220ENST00000550700 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GTI1 187 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 P2RY10O00398 339 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PDCD5O14737 125 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 MAGEB3O15480 346 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 GPX5O75715 221 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SC5DO75845 299 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CST4P01036 141 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 NGFP01138 241 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 IGHV3-13P01766 116 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 FAM157BP0CG42 384 aa8.02□□□□□ -1.13
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