RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM56Q96MV1 263 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 SOX7Q9BT81 388 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 UMAD1C9J7I0 102 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 FADS1O60427 444 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 SBK3P0C264 359 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 COX5AP20674 150 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 FUT3P21217 361 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 PCMT1P22061 227 aa7.66□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 LILRB4Q8NHJ6 448 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 CXorf58Q96LI9 332 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 CRLF2Q9HC73 371 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 CTSFQ9UBX1 484 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 HRASP01112 189 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 NGFRP08138 427 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF425Q6IV72 752 aa7.66□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 GUSBP08236 651 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 PTAFRP25105 342 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 EVX1P49640 407 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 OR5T1Q8NG75 326 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 DHRS3O75911 302 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 PGA3P0DJD8 388 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 NPY4RP50391 375 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 PRRX1P54821 245 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 SSTP61278 116 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 TAF9Q16594 264 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 DOK1Q99704 481 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 HRH4Q9H3N8 390 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R2P9O14990 202 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 CST2P09228 141 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 ACER2Q5QJU3 275 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 FAM122BQ7Z309 247 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.65□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 WDFY2Q96P53 400 aa7.65□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.65□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.65□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 ATP6V1FQ16864 119 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PNR3 127 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 M0QYG6 137 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM18P0DKX4 95 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 PSMB6P28072 239 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 CLDN12P56749 244 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 POU4F3Q15319 338 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 MPPED2Q15777 294 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 SSX1Q16384 188 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
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