RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LHX5	Q9H2C1	402 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR51J1	Q9H342	316 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	XCL2	Q9UBD3	114 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CLN8	Q9UBY8	286 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LRBA	P50851	2863 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRK2	Q5S007	2527 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMB11	A5LHX3	300 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM231B	A6NCW3	169 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	GABRR3	A8MPY1	467 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFAB1	O14561	156 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	AIRE	O43918	545 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	NEMF	O60524	1076 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	EED	O75530	441 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ALDOB	P05062	364 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINA5	P05154	406 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINE2	P07093	398 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CPN2	P22792	545 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CMA1	P23946	247 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	COX7A1	P24310	79 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	HMOX2	P30519	316 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FMO3	P31513	532 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXN2	P32314	431 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC1A2	P43004	574 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SSR4	P51571	173 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	DAOA	P59103	153 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TAS2R19	P59542	299 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB11A	P62491	216 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTA2	P62736	377 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTG2	P63267	376 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTC1	P68032	377 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTA1	P68133	377 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF92	Q03936	586 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJC3	Q13217	504 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CYTH1	Q15438	398 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB11B	Q15907	218 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC00303	Q3SY05	128 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF774	Q6NX45	483 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM54	Q969K7	222 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FCRL1	Q96LA6	429 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM4	Q9C037	500 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RETN	Q9HD89	108 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	EXD2	Q9NVH0	621 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RP1	P56715	2156 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PLXNA2	O75051	1894 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	2.92	□□□□□ -1.94	3e-42	■■■■■ 41.5
SNHG1-222	ENST00000545308	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	NBAS	A2RRP1	2371 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	USP27X	A6NNY8	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC7	O00311	574 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	DYNC1I1	O14576	645 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFSF11	O14788	317 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC16A4	O15374	487 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC37A4	O43826	429 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFSF15	O95150	251 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OTC	P00480	354 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CHTF8	P0CG12	524 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CXCL8	P10145	99 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LIPC	P11150	499 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF250	P15622	560 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RORC	P51449	518 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CARD18	P57730	90 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	DSCR10	P59022	87 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	REG3A	Q06141	175 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FZD2	Q14332	565 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA0087	Q14695	138 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CASC10	Q5T4H9	136 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF544	Q6NX49	715 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM25	Q86YD3	366 aa		2.91	□□□□□ -1.94

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