RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 AMELYQ99218 206 aa7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 KCNJ15Q99712 375 aa7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC6A7Q99884 636 aa7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 COPS4Q9BT78 406 aa7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 NIPAL2Q9H841 368 aa7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 CENPMQ9NSP4 180 aa7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 COPS3Q9UNS2 423 aa7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 F5H5K5 113 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 J3QRE1 110 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 WNT9BO14905 357 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 PNPP00491 289 aa7.39□□□□□ -1.23
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CLSTN3-212ENST00000541770 H2BFMP0C1H6 154 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 COL8A2P25067 703 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 HSD11B1P28845 292 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 DCTDP32321 178 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ATP6V1E1P36543 226 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 HCCSP53701 268 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 SELENOVP59797 346 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 CXCR4P61073 352 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP1CBP62140 327 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF91Q05481 1191 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 EGR3Q06889 387 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB40BQ12829 278 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 TAF13Q15543 124 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 MSMPQ1L6U9 139 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 TREML4Q6UXN2 200 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 USP43Q70EL4 1123 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ABHD4Q8TB40 342 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 RNFT2Q96EX2 444 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 OR8B4Q96RC9 309 aa7.39□□□□□ -1.23
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CLSTN3-212ENST00000541770 MROQ9BYG7 248 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 SP140LQ9H930 580 aa7.39□□□□□ -1.23
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CLSTN3-212ENST00000541770 M0R233 179 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 AVPP01185 164 aa7.38□□□□□ -1.23
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CLSTN3-212ENST00000541770 RAC2P15153 192 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ADRA2CP18825 462 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ACHEP22303 614 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 GCH1P30793 250 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ALDH3B1P43353 468 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 PRKXP51817 358 aa7.38□□□□□ -1.23
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CLSTN3-212ENST00000541770 ACTA1P68133 377 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 FOXL1Q12952 345 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 CDK5R2Q13319 367 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 MOGQ16653 247 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 KLHL22Q53GT1 634 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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CLSTN3-212ENST00000541770 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 SPATC1Q76KD6 591 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 KRT77Q7Z794 578 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 NAA40Q86UY6 237 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 TEX29Q8N6K0 151 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.38□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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