RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ARL5B	Q96KC2	179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		A0A1W2PQD3	144 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		E5RGE8	158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	UPK1A	O00322	258 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ARPC2	O15144	300 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SYT7	O43581	403 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	BANF1	O75531	89 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RP2	O75695	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NDUFA7	O95182	113 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MPZL1	O95297	269 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FGG	P02679	453 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	S100A6	P06703	90 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	IFI6	P09912	130 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NPR2	P20594	1047 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CALCR	P30988	508 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	LCN1	P31025	176 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	EVX1	P49640	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NAAA	Q02083	359 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	BAMBI	Q13145	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	P2RY14	Q15391	338 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RDH5	Q92781	318 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	EME1	Q96AY2	570 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		G3V4G9	280 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SDHD	O14521	159 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR7A17	O14581	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GPR171	O14626	319 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TPST2	O60704	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF254	O75437	659 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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