RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	RMND1	Q9NWS8	449 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	VSIG4	Q9Y279	399 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MYH3	P11055	1940 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SBF2	Q86WG5	1849 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	LAMB2	P55268	1798 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GU03	582 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		F8VZ95	297 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	DFFA	O00273	331 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	HCRTR1	O43613	425 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ALOX12B	O75342	701 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RDH16	O75452	317 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZMPSTE24	O75844	475 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	GFAP	P14136	432 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMB6	P28072	239 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SHC1	P29353	583 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	KDELR2	P33947	212 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEA6	P43360	314 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	DNASE1L1	P49184	302 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MLF1	P58340	268 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TAS2R60	P59551	318 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	UNC119	Q13432	240 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ALX1	Q15699	326 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN26	Q16670	478 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	EOGT	Q5NDL2	527 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	LCN12	Q6JVE5	192 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	AHSA2	Q719I0	299 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD13	Q7L211	337 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OAF	Q86UD1	273 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51A7	Q8NH64	312 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	IFT81	Q8WYA0	676 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C18orf12	Q96KH6	178 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM210A	Q96ND0	272 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RANBP9	Q96S59	729 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMB7	Q99436	277 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	EBF4	Q9BQW3	602 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ASF1A	Q9Y294	204 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	EP400	Q96L91	3159 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	HIDE1	A8MVS5	230 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		F8VP50	259 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		H7C2Y5	167 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGB1BP1	O14713	200 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	COCH	O43405	550 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAPPC6A	O75865	159 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RCBTB2	O95199	551 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	HPRT1	P00492	218 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OXT	P01178	125 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CSF3	P09919	207 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PET100	P0DJ07	73 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB5A	P20339	215 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	P2RY2	P41231	377 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RND2	P52198	227 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A1	P53007	311 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	DLX1	P56177	255 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CXCL6	P80162	114 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MS4A2	Q01362	244 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MXD1	Q05195	221 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PAX8	Q06710	450 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92

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