RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 NBL1P41271 181 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ILKQ13418 452 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARMC12Q5T9G4 340 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 DEGS2Q6QHC5 323 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRP11Q86VZ4 500 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SGPP2Q8IWX5 399 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF680Q8NEM1 530 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR10G6Q8NH81 332 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SGTBQ96EQ0 304 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TVP23CQ96ET8 276 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR4K3Q96R72 315 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 UCK2Q9BZX2 261 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RGS18Q9NS28 235 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAS2R5Q9NYW4 299 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 FHOD3Q2V2M9 1422 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 NINLQ9Y2I6 1382 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 C2orf16Q68DN1 1984 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADGRL1O94910 1474 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MFNGO00587 321 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 HUS1O60921 280 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ERLIN1O75477 346 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR2F2O95006 317 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCNB2O95067 398 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 HBE1P02100 147 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MT-ND4P03905 459 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLTAP09496 248 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRKACBP22694 351 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSMB5P28074 263 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 UQCRFS1P47985 274 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 FABP6P51161 128 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBE2E1P51965 193 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF235Q14590 738 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PGGHGQ32M88 737 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 HSDL1Q3SXM5 330 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 KDM4DQ6B0I6 523 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MED27Q6P2C8 311 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRSS54Q6PEW0 395 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM220Q6QAJ8 160 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OPN5Q6U736 354 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF664Q8N3J9 261 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR10W1Q8NGF6 305 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR56A4Q8NGH8 313 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RXFP4Q8TDU9 374 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 HGDQ93099 445 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPEQ96AT9 228 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 HAUS1Q96CS2 278 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LZTS2Q9BRK4 669 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHCHD7Q9BUK0 85 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM185BQ9H7F4 350 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRC42Q9Y546 428 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MROH7Q68CQ1 1323 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A1B0GUH1 482 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 M0R1X1 148 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 M0R3G1 203 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MANBAO00462 879 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLHL2O95198 593 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 HPRT1P00492 218 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PFN1P07737 140 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYCNOSP40205 109 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RFC3P40938 356 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC1A2P43004 574 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPS15P62841 145 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SP6Q3SY56 376 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC183Q5T5S1 534 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CARD17Q5XLA6 110 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 H3F3CQ6NXT2 135 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC23LQ6PF05 361 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTL4Q6ZR62 310 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MDP1Q86V88 176 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 HORMAD1Q86X24 394 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 DRAM1Q8N682 238 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 C19orf18Q8NEA5 215 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR2Z1Q8NG97 314 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR52E5Q8NH55 327 aa0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms