RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 COMPP49747 757 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 PPP1CAP62136 330 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 CXADRP78310 365 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 GNRHR2Q96P88 292 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 KCNK17Q96T54 332 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 LRP12Q9Y561 859 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.21□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 OR2M5A3KFT3 312 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 CXCL13O43927 109 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 SELENOFO60613 162 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 PRF1P14222 555 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 SHC1P29353 583 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 PMPCAQ10713 525 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 KCNAB1Q14722 419 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TMEM200AQ86VY9 491 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 OSR2Q8N2R0 312 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 OR2AE1Q8NHA4 323 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 MCHR2Q969V1 340 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 REEP6Q96HR9 211 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 OR14A2Q96R54 314 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 CHST5Q9GZS9 411 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 RAB18Q9NP72 206 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 IL19Q9UHD0 177 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 OPN4Q9UHM6 478 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 FAM183AA6NL82 134 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 J3QRK9 145 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 IL2RGP31785 369 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 FABP5Q01469 135 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 OR8G1Q15617 311 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 ATP6V1FQ16864 119 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TMEM100Q9NV29 134 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 OBSL1O75147 1896 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 CD300LBA8K4G0 201 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 HMSDA8MTL9 139 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 J3QT63 122 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TSC22D2O75157 780 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 IFNA2P01563 188 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 GNRHRP30968 328 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 RAB11AP62491 216 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 IL13RA1P78552 427 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 ZNF85Q03923 595 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 GPR157Q5UAW9 335 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 OR52W1Q6IF63 320 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 Q7L0L9 218 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 TCEAL3Q969E4 200 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 LUZP4Q9P127 313 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa5.2□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 ARGFXA6NJG6 315 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 FAM25EA8MYX2 175 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 NDUFB6O95139 128 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 APOL3O95236 402 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 PTAFRP25105 342 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 DUSP1P28562 367 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 RHEBQ15382 184 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
POLK-215ENST00000514141 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms