RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	VSTM2L	Q96N03	204 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHID1	Q9BWS9	393 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHIA	Q9BZP6	476 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF122	Q9H9V4	155 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SMOX	Q9NWM0	555 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TREM2	Q9NZC2	230 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	VSIG4	Q9Y279	399 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	KMT2A	Q03164	3969 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439		A8MUA0	341 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM25E	A8MYX2	175 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC2A10	O95528	541 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CLU	P10909	449 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RALB	P11234	206 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPA2	P15927	270 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF708	P17019	499 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL1RN	P18510	177 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DRD5	P21918	477 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CD9	P21926	228 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CALB2	P22676	271 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CASQ1	P31415	396 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SDC4	P31431	198 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADRA1A	P35348	466 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PPOX	P50336	477 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC25A1	P53007	311 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CTBP2	P56545	445 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CXCL6	P80162	114 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	BST1	Q10588	318 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL18R1	Q13478	541 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PDK3	Q15120	406 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GUSBP1	Q15486	140 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	STK11	Q15831	433 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DCST2	Q5T1A1	773 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LGSN	Q5TDP6	509 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MARC1	Q5VT66	337 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	IFNE	Q86WN2	208 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDH26	Q8IXH8	852 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NECAB1	Q8N987	351 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR2L3	Q8NG85	312 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MUCL1	Q96DR8	90 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PKIB	Q9C010	78 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	VCX2	Q9H322	139 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	C16orf95	Q9H693	158 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439		Q9UF83	564 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SPACA6	W5XKT8	324 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NIN	Q8N4C6	2090 aa		2.56	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439		A0A0U1RQV5	110 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439		A0A1B0GW55	424 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439		E9PBE3	544 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439		K7EQM0	130 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MGRN1	O60291	552 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RDH16	O75452	317 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CIB2	O75838	187 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRAT	O95237	230 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LHB	P01229	141 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPN2	P04844	631 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2

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