RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497318.1

SUPT20H-223, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, human

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUPT20H-223	ENST00000497318	SAA4	P35542	130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	UBE2E1	P51965	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	POU4F2	Q12837	409 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	ATF6B	Q99941	703 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	RHCG	Q9UBD6	479 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	SOCS2	O14508	198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	LHB	P01229	141 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	IFNW1	P05000	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	KDELR2	P33947	212 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	GPR4	P46093	362 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	SELENOW	P63302	87 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	R3HDM4	Q96D70	268 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	CCL13	Q99616	98 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	SSX3	Q99909	188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	CDC42EP2	O14613	210 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	FBXO24	O75426	580 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	MPIG6B	O95866	241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	BLMH	Q13867	455 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	MEP1B	Q16820	701 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	RCN3	Q96D15	328 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318		A0A087WUU8	490 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	BHLHE40	O14503	412 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	FFAR1	O14842	300 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	FCN3	O75636	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	AANAT	Q16613	207 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	WDR38	Q5JTN6	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	NAA40	Q86UY6	237 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	MMP28	Q9H239	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318		M0R135	149 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318		M0R1W7	72 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	PTP4A3	O75365	173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	NPPA	P01160	153 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNF92	Q03936	586 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	KLRD1	Q13241	179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	IKZF1	Q13422	519 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	LY6E	Q16553	131 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318		Q8N7P7	452 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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