RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491834.5

CRBN-210, Transcript of cereblon, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CRBN, Length 5,628 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBN-210ENST00000491834 SYNGR3O43761 229 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 DFFBO76075 338 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 C1QAP02745 245 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 FAM106CPP0CH98 169 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 GZMHP20718 246 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 MAKP20794 623 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 HAAOP46952 286 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 TLE4Q04727 773 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 FAM209BQ5JX69 171 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ETHE1O95571 254 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ATF1P18846 271 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 COX7A1P24310 79 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ZNF117Q03924 483 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 K7ESF4 209 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SPINT1O43278 529 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SOD1P00441 154 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 WNT1P04628 370 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 GYPBP06028 91 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SLC2A1P11166 492 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 METAP1P53582 386 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 TGIF1Q15583 401 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 FADS6Q8N9I5 356 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CMBLQ96DG6 245 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 GPR84Q9NQS5 396 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 MED29Q9NX70 200 aa6.51□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 HMGN4O00479 90 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SULT1B1O43704 296 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CLDN1O95832 211 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 LIPFP07098 398 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 TNFRSF1BP20333 461 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SLC25A1P53007 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.5□□□□□ -1.37
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CRBN-210ENST00000491834 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ZNF724A8MTY0 619 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 PTH2RP49190 550 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 DHODHQ02127 395 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SQSTM1Q13501 440 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 P2RY14Q15391 338 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 KDM8Q8N371 416 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ARL11Q969Q4 196 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ISOC1Q96CN7 298 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ABCG5Q9H222 651 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 FAM60AQ9NP50 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 FBXL17Q9UF56 701 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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CRBN-210ENST00000491834 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SIAH2O43255 324 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CYTIPO60759 359 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CD59P13987 128 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CBR1P16152 277 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ZNF32P17041 273 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SPINK2P20155 84 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 GABRA4P48169 554 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 AQP4P55087 323 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 SSX2Q16385 188 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.5□□□□□ -1.37
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CRBN-210ENST00000491834 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 MUS81Q96NY9 551 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 CCL3P10147 92 aa6.5□□□□□ -1.37
CRBN-210ENST00000491834 ID1P41134 155 aa6.5□□□□□ -1.37
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