RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		G3V3Y1	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OVOL3	O00110	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFSF11	O14788	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LYRM1	O43325	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SSX4	O60224	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TUSC2	O75896	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	WDPCP	O95876	746 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTL6A	O96019	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TTR	P02766	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CST2	P09228	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LIPC	P11150	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF708	P17019	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HSD11B1	P28845	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	BTC	P35070	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DDOST	P39656	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGEB1	P43366	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PTH2R	P49190	550 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LHX2	P50458	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN18	P56856	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CARD18	P57730	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	BTG1	P62324	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HTRA1	Q92743	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HAS2	Q92819	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SPEG	Q15772	3267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0B4J203	849 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PPL8	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SULT1C2	O00338	296 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	XRCC3	O43542	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LANCL1	O43813	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CXCL13	O43927	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CEACAM4	O75871	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	APOC1	P02654	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OPN1LW	P04000	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	AMY1A	P04745	511 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ALDOB	P05062	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SP1	P08047	785 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ADRB1	P08588	477 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ITGA5	P08648	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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