RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR6X1Q8NH79 312 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LHX4Q969G2 390 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR2V2Q96R30 315 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR4F4Q96R69 305 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PPA2Q9H2U2 334 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 BATF3Q9NR55 127 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 A0A087WUU8 490 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 C5orf49A4QMS7 147 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LRRN3E7EW58 273 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 IFNL4K9M1U5 179 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FCN3O75636 299 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR5F1O95221 314 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TFAP2AP05549 437 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 QDPRP09417 244 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PGA4P0DJD7 388 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PGA3P0DJD8 388 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CD28P10747 220 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 KITLGP21583 273 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TNFSF4P23510 183 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GGT2P36268 569 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PMELP40967 661 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 UGT2B15P54855 530 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 IL5RAQ01344 420 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 HSF2Q03933 536 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ST3GAL3Q11203 375 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TRAM2Q15035 370 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR1Q1Q15612 314 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 HIST3H3Q16695 136 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 C1orf94Q6P1W5 598 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NKAIN4Q8IVV8 208 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LRRC18Q8N456 261 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SCCPDHQ8NBX0 429 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MUC7Q8TAX7 377 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ABHD4Q8TB40 342 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 APH1BQ8WW43 257 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 DGCR6LQ9BY27 220 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 POFUT1Q9H488 388 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CTSZQ9UBR2 303 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.91□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1B0GWA3 101 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZAR1LA6NP61 321 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 M0R129 80 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC1A7O00341 560 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SURF4O15260 269 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FMO6PO60774 539 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 WBP4O75554 376 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SERPINI2O75830 405 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SOX14O95416 240 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FBP1P09467 338 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OSMP13725 252 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF32P17041 273 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CD33P20138 364 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CRHBPP24387 322 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FMO3P31513 532 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RPL4P36578 427 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OMPP47874 163 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NPY4RP50391 375 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CRISP1P54107 249 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PSG4Q00888 419 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 KLHL22Q53GT1 634 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SATL1Q86VE3 508 aa5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms