RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 OOEPA6NGQ2 149 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GGT3PA6NGU5 568 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 M0R135 149 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RENP00797 406 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SELLP14151 372 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 IER3P46695 156 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 NUDT2P50583 147 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CSNK2BP67870 215 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TAF9Q16594 264 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RFX4Q33E94 735 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 METTL11BQ5VVY1 283 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZSV7 163 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ZNF799Q96GE5 643 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 MMP27Q9H306 513 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GUS0 222 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 FSTL3O95633 263 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RHCEP18577 417 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CPT2P23786 658 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PAX6P26367 422 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SLC6A6P31641 620 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TPTEP56180 551 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PSME3P61289 254 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SPIBQ01892 262 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CD276Q5ZPR3 534 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TMEM86BQ8N661 226 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TRIM15Q9C019 465 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TIMM23O14925 209 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GYPBP06028 91 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 NOS3P29474 1203 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 EGR3Q06889 387 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ECH1Q13011 328 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 IKZF1Q13422 519 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PCK2Q16822 640 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SLC36A3Q495N2 470 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 WDR38Q5JTN6 314 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GLYATQ6IB77 296 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ZNF511Q8NB15 262 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 LRRC29Q8WV35 223 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 C17orf50Q8WW18 174 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 DYRK2Q92630 601 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ERGIC1Q969X5 290 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CENPMQ9NSP4 180 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 G3V4G9 280 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ACOT8O14734 319 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ARPC3O15145 178 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 GMDSO60547 372 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 CLPXO76031 633 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 GADD45GO95257 159 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 LHBP01229 141 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 SPARCP09486 303 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 CLUP10909 449 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 AMY2BP19961 511 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 NPY4RP50391 375 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 KRT72Q14CN4 511 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 PDCD1Q15116 288 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 OCLNQ16625 522 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 LINC00471Q8N535 108 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTB-209ENST00000473257 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
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