RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 MYOM2P54296 1465 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DCCP43146 1447 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 MAP3K5Q99683 1374 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DENND4AQ7Z401 1863 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 A0A0J9YXV3 536 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 A0A1B0GW55 424 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PLPP1O14494 284 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 OR2J3O76001 311 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 GLSO94925 669 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 IGHV3-11P01762 117 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PRLHRP49683 370 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP12-4P60329 112 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CYP24A1Q07973 514 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DGCR6Q14129 220 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CHRNA6Q15825 494 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TEX30Q5JUR7 227 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 APH1BQ8WW43 257 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 DUX4Q9UBX2 424 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ABCC5O15440 1437 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PIK3C2BO00750 1634 aa3.01□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ADCY9O60503 1353 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SHROOM3Q8TF72 1996 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 EFCAB6Q5THR3 1501 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 H7C1H1 209 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SERPINE2P07093 398 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SLC1A1P43005 524 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 FAM222AQ5U5X8 452 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CASP12Q6UXS9 341 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 IQCKQ8N0W5 287 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 OR5T1Q8NG75 326 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 RHOXF2Q9BQY4 288 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SEC16AO15027 2179 aa3□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 A0A1W2PNN7 141 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 FLOT1O75955 427 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 YIF1BQ5BJH7 314 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 C9orf135Q5VTT2 229 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 REEP3Q6NUK4 255 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 NPSR1Q6W5P4 371 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 FAM228AQ86W67 206 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 FAM71AQ8IYT1 594 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ACMSDQ8TDX5 336 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CAPSLQ8WWF8 208 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD60Q9BZ19 345 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 COX16Q9P0S2 106 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 NWD2Q9ULI1 1742 aa2.99□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CROCC2H7BZ55 1655 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PLCH1Q4KWH8 1693 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 FYCO1Q9BQS8 1478 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 USP32Q8NFA0 1604 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 RAD51CO43502 376 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CLDN11O75508 207 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PAHP00439 452 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 PRKCDQ05655 676 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 NCF4Q15080 339 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CBR4Q8N4T8 237 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SLC35G3Q8N808 338 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 OR56B2PQ8NGI1 322 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 OR51E1Q8TCB6 317 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SLC2A14Q8TDB8 520 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TVP23CQ96ET8 276 aa2.98□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
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