RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM19Q96HH6 336 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 PANX1Q96RD7 426 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 PITX2Q99697 317 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 FAM110AQ9BQ89 295 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 RETNQ9HD89 108 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 POLE4Q9NR33 117 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 INIPQ9NRY2 104 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 C14orf119Q9NWQ9 140 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 HILPDAQ9Y5L2 63 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf3-211ENST00000463372 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 OR6C6A6NF89 314 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 KRT75O95678 551 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ASAH2BP0C7U1 165 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ENTPD1P49961 510 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A1P53007 311 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 PMS2P11Q13670 270 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 KRT72Q14CN4 511 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ARMC4Q5T2S8 1044 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 STUMQ69YW2 141 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 PGAP1Q75T13 922 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SPC24Q8NBT2 197 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ALG12Q9BV10 488 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 DNAH11Q96DT5 4516 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SAP30O75446 220 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 TCP1P17987 556 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 DSTNP60981 165 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 MALLQ13021 153 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 FHL3Q13643 280 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF788Q6ZQV5 615 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 GAFA1Q96PS6 74 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 TXNIPQ9H3M7 391 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SNTG1Q9NSN8 517 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 HAO2Q9NYQ3 351 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ODF3BA8MYP8 253 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 M0QZK8 103 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 AMY1AP04745 511 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 AMY2AP04746 511 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SCG5P05408 212 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 FGF4P08620 206 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 AQP6Q13520 282 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 TIFABQ6ZNK6 161 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SLC35F6Q8N357 371 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 OR13D1Q8NGV5 346 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 STMN2Q93045 179 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 HIPK2Q9H2X6 1198 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 USE1Q9NZ43 259 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 NINJ2Q9NZG7 142 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 KIAA1456Q9P272 454 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ATPIF1Q9UII2 106 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 BTNL2Q9UIR0 455 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 LRP12Q9Y561 859 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 CCRL2O00421 344 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SIGLEC5O15389 551 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 OR2F2O95006 317 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 CD24P25063 80 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 GMFBP60983 142 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SPANXN4Q5MJ08 99 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 Q8N1Y9 231 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 DRAM1Q8N682 238 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 AGR3Q8TD06 166 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 TESCQ96BS2 214 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 NABP2Q9BQ15 211 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 C19orf12Q9NSK7 152 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 DCDC2Q9UHG0 476 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 EMCNQ9ULC0 261 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 CD300LBA8K4G0 201 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 SERPINE3A8MV23 424 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 M0R3H8 397 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 IMPA2O14732 288 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 PSPNO60542 156 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 TFF1P04155 84 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
C9orf3-211ENST00000463372 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms