RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	LRGUK	Q96M69	825 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FEV	Q99581	238 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MRI1	Q9BV20	369 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OPA3	Q9H6K4	179 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MARCH7	Q9H992	704 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	DHRS12	A0PJE2	317 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP12B	A6NM10	295 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CST1	P01037	141 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GRK5	P34947	590 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKX	P51817	358 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GNB2	P62879	340 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8G1	Q15617	311 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	TREML4	Q6UXN2	200 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	DOK3	Q7L591	496 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	THTPA	Q9BU02	230 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPM	Q9NSP4	180 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF69	Q9UC07	566 aa		14.79	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GGT3P	A6NGU5	568 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	XRCC2	O43543	280 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC2A1	P11166	492 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	IRF2	P14316	349 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PRTN3	P24158	256 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMB10	P40306	273 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8B2	Q96RD0	313 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	TOR3A	Q9H497	397 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MED20	Q9H944	212 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		14.78	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM183A	A6NL82	134 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BN98	237 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PHYH	O14832	338 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	GLCE	O94923	617 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC15A1	P46059	708 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PITPNB	P48739	271 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF13	Q15543	124 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TIGD4	Q8IY51	512 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SPERT	Q8NA61	448 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	UPRT	Q96BW1	309 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	INTS14	Q96SY0	518 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ABHD6	Q9BV23	337 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF7	Q9UBF6	113 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CLN8	Q9UBY8	286 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		14.77	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	DDOST	P39656	456 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CX3CR1	P49238	355 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	AMELY	Q99218	206 aa		14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	POM121C	A8CG34	1229 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	LGALS8	O00214	317 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	DYNC1I1	O14576	645 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PLAT	P00750	562 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	GSTT1	P30711	240 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OPRL1	P41146	370 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM3A	P98173	230 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATC1	Q76KD6	591 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SHF	Q7M4L6	423 aa		14.75	□□□□□ -0.05

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