RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2V2Q15819 145 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 BLNKQ8WV28 456 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GALMQ96C23 342 aa6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 BCKDHAP12694 445 aa6.06□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.06□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR2M2Q96R28 347 aa6.06□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 FAAHO00519 579 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ENTPD6O75354 484 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 NFATC1O95644 943 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 EDNRBP24530 442 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ITGB7P26010 798 aa6.05□□□□□ -1.44
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