RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 ZNF687Q8N1G0 1237 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 HBE1P02100 147 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 FAM157BP0CG42 384 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD16Q6P6B7 361 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 OR52B4Q8NGK2 314 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 GLAP06280 429 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 OR5H8P0DN80 308 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.577e-7■□□□□ 10.1
NISCH-201ENST00000345716 BAMBIQ13145 260 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 ZNF732B4DXR9 585 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 AKR7A2O43488 359 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 AADACP22760 399 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 THBS4P35443 961 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 CSRP3P50461 194 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 DECR2Q9NUI1 292 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 PMS2P1A4D2B8 440 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 SLC22A20A6NK97 555 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 PLPP3O14495 311 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 CTLA4P16410 223 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 KITLGP21583 273 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 PSMB6P28072 239 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 ST3GAL6Q9Y274 331 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 MTCH2Q9Y6C9 303 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 DUSP1P28562 367 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 HAAOP46952 286 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 DEFB109BQ30KR1 87 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 PP6455Q8WZ26 134 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 FRZBQ92765 325 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 MARC2Q969Z3 335 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 FSCN3Q9NQT6 498 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 CES1P1Q9UKY3 287 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 A8MXE2 369 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 RER1O15258 196 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 RGS11O94810 467 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 BAXQ07812 192 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 OR1C1Q15619 314 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 TAF9BQ9HBM6 251 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 BRWD1Q9NSI6 2320 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 GFOD1Q9NXC2 390 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 PLA2G3Q9NZ20 509 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 SIRPB1O00241 398 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 FZD5Q13467 585 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 SFTPA2Q8IWL1 248 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 OR13C8Q8NGS7 320 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 FAM173AQ9BQD7 235 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-201ENST00000345716 IL2RAP01589 272 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 LSMEM1Q8N8F7 131 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 TMEM229BQ8NBD8 167 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 OR1F12Q8NHA8 337 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 PROCRQ9UNN8 238 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 C17orf112F2Z3M2 114 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 RRP8O43159 456 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 PTAFRP25105 342 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 ZNF85Q03923 595 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 FCGR2CP31995 323 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 TMEM52Q8NDY8 209 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 OR1S2Q8NGQ3 325 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 UBE2KP61086 200 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 CST9LP1Q5W188 147 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 DHRS13Q6UX07 377 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 OR4S1Q8NGB4 309 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 EPPINO95925 133 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 FUT7Q11130 342 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 C1QL3Q5VWW1 255 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 DEGS2Q6QHC5 323 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 LYG2Q86SG7 212 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 SLC39A9Q9NUM3 307 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 SH2D1BO14796 132 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 ALX3O95076 343 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 IGHV4-34P06331 123 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 NFYBP25208 207 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 D2HGDHQ8N465 521 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 DTWD2Q8NBA8 298 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 SEC16AO15027 2179 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 NKX6-3A6NJ46 265 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 ANGPTL7O43827 346 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 ACER2Q5QJU3 275 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 TCTE3Q8IZS6 198 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-201ENST00000345716 ZNF321PQ8N8H1 164 aa18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms