RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 EBAG9O00559 213 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLPP2O43688 288 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SBK2P0C263 348 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCMT1P22061 227 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMELP40967 661 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCCSP53701 268 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM155Q4W5P6 130 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRN1Q6UXK5 716 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCEANCQ8N8B7 351 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM163Q8TC26 289 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGK3Q96BR1 496 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 REEP6Q96HR9 211 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKP2Q99959 881 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABARAPL3Q9BY60 117 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A4Q9H015 551 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SP140LQ9H930 580 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 G6PC2Q9NQR9 355 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MXRA5Q9NR99 2828 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNA2P01563 188 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANPEPP15144 967 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM3AP98173 230 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8G1Q15617 311 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIGD6Q17RP2 521 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 AADACL4Q5VUY2 407 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPICQ8N5J4 248 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52H1Q8NGJ2 320 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRD7Q9NPI1 651 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRP12Q9Y561 859 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL6A5A8TX70 2615 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR32B1ATL7 298 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDH2P40926 338 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8TCH9 128 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGAM5Q96HS1 289 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10A2Q9H208 303 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPS3Q9UNS2 423 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 F5H0A9 414 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 GMDSO60547 372 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPPED2Q15777 294 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFOD2Q3B7J2 385 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT77Q7Z794 578 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL36Q8N4N3 616 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFLNBQ8N5W9 214 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDFIQ99750 246 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGCCQ9H4X1 137 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 NIPAL2Q9H841 368 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRL4Q9HBW9 690 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC30A6NM36 301 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM20BO75063 409 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF205O95201 554 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNPP00491 289 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDOSTP39656 456 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM201AQ5SY85 155 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERGIC1Q969X5 290 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 UFSP2Q9NUQ7 469 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHB10Q9UN67 800 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEACAM18A8MTB9 384 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMD9O00233 223 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 EI24O14681 340 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALPLP05186 524 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRP14P37108 136 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSK3AP49840 483 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCN2P80188 198 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROM1Q03395 351 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8B8Q15620 311 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms