RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF814B7Z6K7 855 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NPIPA2E9PIF3 369 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NPIPA3F8WFD2 350 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CTAG2O75638 210 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHG1P01857 330 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHG3P01860 377 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PGA4P0DJD7 388 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PGA3P0DJD8 388 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SRD5A2P31213 254 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 MMP16P51512 607 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TNK1Q13470 666 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ELFN2Q5R3F8 820 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CD276Q5ZPR3 534 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FGD2Q7Z6J4 655 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PRR7Q8TB68 274 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A28Q96A46 364 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SLAMF6Q96DU3 332 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CITED4Q96RK1 184 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ACKR4Q9NPB9 350 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 B3GNT2Q9NY97 397 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa13.95□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 MEGF11A6BM72 1044 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SMLR1H3BR10 107 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ZIC3O60481 467 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ABOP16442 354 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FSTP19883 344 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC35A1P78382 337 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 OLFML2AQ68BL7 652 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 OR11H7Q8NGC8 314 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 OR6X1Q8NH79 312 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 C20orf85Q9H1P6 137 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC17A5Q9NRA2 495 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SPRR3Q9UBC9 169 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ATPIF1Q9UII2 106 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 OSGIN2Q9Y236 505 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 AUP1Q9Y679 476 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAJC13O75165 2243 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1W2PPL8 197 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 GGT3PA6NGU5 568 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 LEUTXA8MZ59 168 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SULT2B1O00204 365 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 P2RY10O00398 339 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFA2O43678 99 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RBBP9O75884 186 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF43P17038 809 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PRKACAP17612 351 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 DCTDP32321 178 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RAET1LQ5VY80 246 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL24Q6TFL4 600 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 HDDC2Q7Z4H3 204 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 BIVMQ86UB2 503 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5M9Q8NGP3 310 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 OR10Z1Q8NGY1 313 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 C1orf198Q9H425 327 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SEC61A2Q9H9S3 476 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 EMC7Q9NPA0 242 aa13.94□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 MED12Q93074 2177 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV18A0A075B6X5 111 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 AQP7P3A6NL99 342 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 LMX1BO60663 402 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RAMP1O60894 148 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PEX14O75381 377 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TPOP07202 933 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 HTR2CP28335 458 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RBPJQ06330 500 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 GLYATL3Q5SZD4 288 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CARD17Q5XLA6 110 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TMPPEQ6ZT21 453 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CREB3L2Q70SY1 520 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CDH24Q86UP0 819 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 BEST4Q8NFU0 473 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SNAPC3Q92966 411 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PHF21AQ96BD5 680 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SFXN2Q96NB2 322 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNK15Q9H427 330 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 BEX1Q9HBH7 125 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM206AQ9NX38 181 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF222Q9UK12 451 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FLVCR2Q9UPI3 526 aa13.93□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF726A6NNF4 738 aa13.92□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 H7C417 338 aa13.92□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 J3QKU1 62 aa13.92□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FABP7O15540 132 aa13.92□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 STARP49675 285 aa13.92□□□□□ -0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 C3AR1Q16581 482 aa13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms