RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MS4A18H0YCH9 400 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 GPX2P18283 190 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RAB7AP51149 207 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FAM53BQ14153 422 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLC7A6Q92536 515 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MISP3Q96FF7 219 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.48□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PRSS37A4D1T9 235 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 IGHV3-9P01782 118 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PFN3P60673 137 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TVP23CQ96ET8 276 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PPP1CBP62140 327 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FIZ1Q96SL8 496 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZNF724A8MTY0 619 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 EPHA2P29317 976 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DAPP51397 102 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PIGPP57054 158 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ASAH1Q13510 395 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 IGFBP7Q16270 282 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PYCR3Q53H96 274 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RAB18Q9NP72 206 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TDHQ8IZJ6 230 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CTSFQ9UBX1 484 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 HERVK_113P61574 105 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 JAG1P78504 1218 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZNF534Q76KX8 674 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TCAPO15273 167 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 HPP00738 406 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LHX4Q969G2 390 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 EGR3Q06889 387 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SYT14P1Q58G82 188 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ARRB2P32121 409 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FAM157BP0CG42 384 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 B4GALT1P15291 398 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 VPS25Q9BRG1 176 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 THYN1Q9P016 225 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MYLKQ15746 1914 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CBR3O75828 277 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CCR6P51684 374 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 EMP3P54852 163 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR52N5Q8NH56 324 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 DDOQ99489 341 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 F11P03951 625 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LIMS3P0CW19 117 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LIMS4P0CW20 117 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.47□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 IDSB3KWA1 339 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 OR2J3O76001 311 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 HAAOP46952 286 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FAM71E1Q6IPT2 247 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LRRTM1Q86UE6 522 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 LAX1Q8IWV1 398 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 SP1P08047 785 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 PSENENQ9NZ42 101 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CD22P20273 847 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 C12orf10Q9HB07 376 aa8.46□□□□□ -1.05
CUX1-201ENST00000292535 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms