RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262304.8

PKD1-201, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKD1, Length 14,138 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-201ENST00000262304 CTSFQ9UBX1 484 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ID4P47928 161 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 TM4SF4P48230 202 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 GUK1Q16774 197 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 HES3Q5TGS1 186 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 WDR1O75083 606 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RBP4P02753 201 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 S100A8P05109 93 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CEBPBP17676 345 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 DCTDP32321 178 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 MIDNQ504T8 468 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 BET1LQ9NYM9 111 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ADAM11O75078 769 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 SEMA3BQ13214 749 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 FAM219AQ8IW50 185 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RHOFQ9HBH0 211 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 FZR1Q9UM11 496 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ATP1B1P05026 303 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RAB38P57729 211 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CMTM4Q8IZR5 234 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 FOXK2Q01167 660 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 PLPP6Q8IY26 295 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 TMEM230Q96A57 120 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RHOVQ96L33 236 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 SERTM1A2A2V5 107 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 KCNAB1Q14722 419 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 H0YGG7 62 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 GUCA2AQ02747 115 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ZNF85Q03923 595 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 WNT11O96014 354 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CST2P09228 141 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CLMPQ9H6B4 373 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ETV7Q9Y603 341 aa9.3□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CLDN24A6NM45 220 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 FAM78BQ5VT40 261 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ZNF716A6NP11 495 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 DUSP2Q05923 314 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CHRM2P08172 466 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CAMPP49913 170 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 TAS2R45P59539 299 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RNF2Q99496 336 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 FAM157BP0CG42 384 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CCR9P51686 369 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 STUMQ69YW2 141 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 SNX22Q96L94 193 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 SLC22A12Q96S37 553 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 HES4Q9HCC6 221 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 OR5B21A6NL26 309 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ERVS71-1P61550 626 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 TCEAL1Q15170 157 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 ATP5SQ99766 215 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CTSCP53634 463 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 INHBCP55103 352 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 VASH2Q86V25 355 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 M0R143 59 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 C1QBP02746 253 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 CD37P11049 281 aa9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKD1-201ENST00000262304 LYSMD4Q5XG99 296 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms