RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TMEM230Q96A57 120 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 CHST6Q9GZX3 395 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 A0A0U1RQS6 177 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 M0R2Z0 102 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 H0YIV9 168 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 SIRPB1O00241 398 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TP53RKQ96S44 253 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ST8SIA5O15466 376 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TBXA2RP21731 343 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 SLC6A12P48065 614 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 SHHQ15465 462 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ZNF785A8K8V0 405 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 MMP11P24347 488 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ABCD3P28288 659 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 CYBAP13498 195 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 EPHA2P29317 976 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 OPRM1P35372 400 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 HERVK_113P61574 105 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ZNF385BQ569K4 471 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 CLLU1Q5K131 121 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 LILRA2Q8N149 483 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 HCRTR1O43613 425 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ARR3P36575 388 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 FZD6O60353 706 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 CTSCP53634 463 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 MANEAQ5SRI9 462 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 FAM210BQ96KR6 192 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 KCNK15Q9H427 330 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 HES4Q9HCC6 221 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.44□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 DEDDO75618 318 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 BMP5P22003 454 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 EMC4Q5J8M3 183 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 HGDQ93099 445 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 SEMA7AO75326 666 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 SEMG1P04279 462 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 PMP22Q01453 160 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ASIC5Q9NY37 505 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 IL17CQ9P0M4 197 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 HPP00738 406 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 OR3A1P47881 315 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 EXD3Q8N9H8 876 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ADGRG7Q96K78 797 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 GLIPR2Q9H4G4 154 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ADGRL4Q9HBW9 690 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TPBGQ13641 420 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 Q3ZCU0 254 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 PLPP6Q8IY26 295 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 ACY3Q96HD9 319 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 OCEL1Q9H607 264 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 TBX19O60806 448 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 CD99P14209 185 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 CD200P41217 278 aa8.43□□□□□ -1.06
TNS1-201ENST00000171887 SULT1A1P50225 295 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms