RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARP8	Q8N3A8	854 aa		14.02	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		14.02	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ST7L	Q8TDW4	575 aa		14.02	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM186	Q96B77	213 aa		14.02	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC22A4	Q9H015	551 aa		14.02	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		14.02	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	NF1	P21359	2839 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC30	A6NM36	301 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD300LB	A8K4G0	201 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035		H0YL77	283 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	EBAG9	O00559	213 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	XRCC2	O43543	280 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	HLA-DPB1	P04440	258 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	LYN	P07948	512 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	IRF2	P14316	349 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	CX3CR1	P49238	355 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIGD6	Q17RP2	521 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIGD4	Q8IY51	512 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPIC	Q8N5J4	248 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	OPA3	Q9H6K4	179 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MARCH7	Q9H992	704 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	GCM1	Q9NP62	436 aa		14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZAN	Q9Y493	2812 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035		F5H5P2	479 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	SELENOF	O60613	162 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV2-5	P01817	119 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF92	Q03936	586 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	APOF	Q13790	326 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR8G1	Q15617	311 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASRGL1	Q7L266	308 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	OTOS	Q8NHW6	89 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	BRD7	Q9NPI1	651 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		14	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MLNR	O43193	412 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	CA6	P23280	308 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDOST	P39656	456 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	BTG1	P62324	171 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEAD3	Q99594	435 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.99	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLPP2	O43688	288 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	GMDS	O60547	372 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MMP16	P51512	607 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPERT	Q8NA61	448 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		13.98	□□□□□ -0.17
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0G2JMP0	313 aa		13.97	□□□□□ -0.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms