RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf135Q5VTT2 229 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM45BQ96B21 275 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 GLTPQ9NZD2 209 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNS2Q9ULS6 477 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 TVP23AA6NH52 213 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 HLA-DQA2P01906 255 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF823P16415 610 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 CELP19835 753 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 VBP1P61758 197 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMK2DQ13557 499 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPO2Q5TGU0 170 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 DEGS2Q6QHC5 323 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 LYPD4Q6UWN0 246 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 DPY19L4Q7Z388 723 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf78Q8N4C9 275 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A15Q8N5U1 240 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS4Y2Q8TD47 263 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 MCHR2Q969V1 340 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 PELI1Q96FA3 418 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 RERGLQ9H628 205 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 C20orf196Q8IYI0 205 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXN4Q96NZ1 517 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFS8O00217 210 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT8P05787 483 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 CSNK1A1P48729 337 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 FMODQ06828 376 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 FDX2Q6P4F2 183 aa20.78■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 A3GALT2U3KPV4 340 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6C65A6NJZ3 312 aa20.77■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF254O75437 659 aa20.77■□□□□ 0.92
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR8B4Q96RC9 309 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPOQ9BU64 300 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 PARPBPQ9NWS1 579 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-216ENST00000628306 E9PI62 339 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC43A1O75387 559 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 BMP4P12644 408 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 LSM3P62310 102 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 LSM6P62312 80 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 TP53I3Q53FA7 332 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF679Q8IYX0 411 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 RFLNBQ8N5W9 214 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf159Q96HA4 380 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.76■□□□□ 0.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 GNG8Q9UK08 70 aa20.76■□□□□ 0.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 NDNFQ8TB73 568 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 THEM6Q8WUY1 208 aa20.75■□□□□ 0.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 PHYHIPQ92561 330 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM19Q96E16 107 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 PIMREGQ9BSJ6 248 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa20.75■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 DHHO43323 396 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINA3P01011 423 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 MPGP29372 298 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 DCTDP32321 178 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB10P48595 397 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS25P62851 125 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 HIKESHIQ53FT3 197 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa20.74■□□□□ 0.91
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