RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM100	Q9NV29	134 aa		12.36	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	DUX4	Q9UBX2	424 aa		12.36	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		12.36	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	TMPRSS2	O15393	492 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	PLAT	P00750	562 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	GAST	P01350	101 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	SFTPB	P07988	381 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	OMG	P23515	440 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	CD200	P41217	278 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	PITPNB	P48739	271 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	POU4F2	Q12837	409 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	WDR86	Q86TI4	376 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	LNX2	Q8N448	690 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	UPRT	Q96BW1	309 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	NTN4	Q9HB63	628 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		12.35	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	CD300LB	A8K4G0	201 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	GMNN	O75496	209 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	GATA4	P43694	442 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	PRKX	P51817	358 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	FGF12	P61328	243 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	CRMP1	Q14194	572 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	PGAP1	Q75T13	922 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	OR8B2	Q96RD0	313 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	AMELY	Q99218	206 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF747	Q9BV97	191 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	MED20	Q9H944	212 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	MIOX	Q9UGB7	285 aa		12.34	□□□□□ -0.43
FCHO1-231	ENST00000600201	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	TNFRSF11B	O00300	401 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	SPARC	P09486	303 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	PSMB10	P40306	273 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	SMIM11A	P58511	58 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	OR8G1	Q15617	311 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC36A3	Q495N2	470 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201		Q8TCH9	128 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	SEH1L	Q96EE3	360 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201		U3KQV3	271 aa		12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	TFF1	P04155	84 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF823	P16415	610 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	MAGEA2	P43356	314 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	TPTE	P56180	551 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	GNGT1	P63211	74 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	MS4A2	Q01362	244 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	TECTB	Q96PL2	329 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	TBX15	Q96SF7	602 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	CENPM	Q9NSP4	180 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	IL20	Q9NYY1	176 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	CLN8	Q9UBY8	286 aa		12.32	□□□□□ -0.44
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM183A	A6NL82	134 aa		12.31	□□□□□ -0.44

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