RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 PCOLCEQ15113 449 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 AWAT2Q6E213 333 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 LIN54Q6MZP7 749 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 TSSK4Q6SA08 328 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 BEND4Q6ZU67 534 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 DOK3Q7L591 496 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 OR8S1Q8NH09 359 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 AQP3Q92482 292 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 MR1Q95460 341 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 FGGYQ96C11 551 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 POFUT1Q9H488 388 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 GAREM1Q9H706 876 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF25Q9UIL4 384 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 AUP1Q9Y679 476 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 PLSCR5A0PG75 271 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 DNPH1O43598 174 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 TOXO94900 526 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF35P13682 527 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP3CBP16298 524 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 MSR1P21757 451 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CCL1P22362 96 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 FOLR3P41439 243 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CBX5P45973 191 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CSNK1A1P48729 337 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CX3CR1P49238 355 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 ARL6IP1Q15041 203 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 POU4F3Q15319 338 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 GRK1Q15835 563 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 OTPQ5XKR4 325 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CORO6Q6QEF8 472 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 REC114Q7Z4M0 266 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 ACBD4Q8NC06 268 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CHST4Q8NCG5 386 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 OR51A2Q8NGJ7 313 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 EMC6Q9BV81 110 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CA10Q9NS85 328 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 GHRLQ9UBU3 117 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 OPN4Q9UHM6 478 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
EFTUD2-222ENST00000592408 SPTBP11277 2137 aa8.15□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 EML5Q05BV3 1969 aa8.15□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A096LPE4 126 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PPZ6 126 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 G3V3Q6 166 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 IFNA6P05013 189 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4E1P0C645 316 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 LIFP15018 202 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 CD34P28906 385 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 SSTR2P30874 369 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 S100A11P31949 105 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 SFTPDP35247 375 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 THBS4P35443 961 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF84P51523 738 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 P2RY4P51582 365 aa8.14□□□□□ -1.11
EFTUD2-222ENST00000592408 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms