RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TLCD2A6NGC4 264 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SAGE2PA6NJ88 616 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SGK494L7N484 410 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CHST10O43529 356 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKYO43930 277 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FCMRO60667 390 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DFFBO76075 338 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GUSBP08236 651 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CT62P0C5K7 136 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GLRA1P23415 457 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CD40LGP29965 261 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TGFBR1P36897 503 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR4P46093 362 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OMPP47874 163 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PDLIM4P50479 330 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF136P52737 540 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT4P56705 351 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1CAP62136 330 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 BTG1P62324 171 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB40BQ12829 278 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 BIKQ13323 160 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SERTAD2Q14140 314 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM53BQ14153 422 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1Q1Q15612 314 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TWIST1Q15672 202 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ETFDHQ16134 617 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM16LQ309B1 348 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PGGHGQ32M88 737 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNJQ5T5M9 372 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF613Q6PF04 617 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf48Q6RUI8 117 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF550Q7Z398 422 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GID4Q8IVV7 300 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NRMQ8IXM6 262 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL14Q8N4G2 192 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF614Q8N883 585 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2T33Q8NG76 320 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52R1Q8NGF1 315 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52I1Q8NGK6 324 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FANK1Q8TC84 345 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LMX1AQ8TE12 382 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RLN3Q8WXF3 142 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35B4Q969S0 331 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP19Q96LK0 163 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OPALINQ96PE5 141 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5M11Q96RB7 305 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ALG12Q9BV10 488 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GON7Q9BXV9 100 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51E2Q9H255 320 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DSN1Q9H410 356 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM60AQ9NP50 221 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 STARD5Q9NSY2 213 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FLRT3Q9NZU0 649 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SSR3Q9UNL2 185 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 B9D1Q9UPM9 204 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 F5P12259 2224 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EYSQ5T1H1 3165 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A075B6Q4 140 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ISPDA4D126 451 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NPIPA7E9PJI5 369 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SURF4O15260 269 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 AQP9O43315 295 aa3.59□□□□□ -1.83
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