RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTA2P62736 377 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTG2P63267 376 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 NAAAQ02083 359 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 PLP2Q04941 152 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 EGR3Q06889 387 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 BSPH1Q075Z2 132 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2UQ5VVX9 321 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM5Q6NVV9 412 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
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CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS45Q7RTY3 260 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 CATSPERDQ86XM0 798 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SYS1Q8N2H4 156 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 KBTBD8Q8NFY9 601 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD4Q8TB40 342 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ASB17Q8WXJ9 295 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF799Q96GE5 643 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 PGAM5Q96HS1 289 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 C4orf45Q96LM5 186 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 COG8Q96MW5 612 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 MNTQ99583 582 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 DOK1Q99704 481 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 COQ7Q99807 217 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 TMED9Q9BVK6 235 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 MROQ9BYG7 248 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 HDHD2Q9H0R4 259 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 OR51E2Q9H255 320 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SCOCQ9UIL1 159 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 STARD10Q9Y365 291 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 R4GMQ9 66 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PPR1 153 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 DPPA5A6NC42 116 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBAL3A6NHL2 446 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ACOD1A6NK06 481 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS44E7EML9 344 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCD4O14678 606 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 PHYHO14832 338 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 OGG1O15527 345 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SMPD2O60906 423 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 GPX5O75715 221 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SULT1C4O75897 302 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFPL1O95159 310 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV3-15P01624 115 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV1-44P01699 117 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF35P13682 527 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 CD36P16671 472 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 CD40P25942 277 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF92Q03936 586 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 BLMHQ13867 455 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK5R1Q15078 307 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 NRN1LQ496H8 165 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR107Q5VW38 600 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 RNLSQ5VYX0 342 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 MTFR2Q6P444 385 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 XKRXQ6PP77 449 aa5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-208ENST00000589162 RNF144BQ7Z419 303 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 LRP11Q86VZ4 500 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 COMMD2Q86X83 199 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 PHC2Q8IXK0 858 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5AS1Q8N127 324 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 GHSRQ92847 366 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SPTSSAQ969W0 71 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 SGK3Q96BR1 496 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 MUCL1Q96DR8 90 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 YIPF6Q96EC8 236 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.19□□□□□ -1.58
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