RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	GNG8	Q9UK08	70 aa		21.32	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	LY6H	O94772	140 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	PAX1	P15863	534 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	HSPA13	P48723	471 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF81	P51508	661 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF92	Q03936	586 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	CARTPT	Q16568	116 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	KLHL22	Q53GT1	634 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	COMMD2	Q86X83	199 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	HAVCR1	Q96D42	359 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	REEP6	Q96HR9	211 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	MSL2	Q9HCI7	577 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		21.31	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	GGT3P	A6NGU5	568 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	SPRY3	O43610	288 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	SELE	P16581	610 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	KITLG	P21583	273 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	EFNA4	P52798	201 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF85	Q03923	595 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	RAB40B	Q12829	278 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	TP53I3	Q53FA7	332 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	METTL15	A6NJ78	407 aa		21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	C17orf100	A8MU93	164 aa		21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	FAM20B	O75063	409 aa		21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	CDK5R2	Q13319	367 aa		21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		21.29	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	LIPA	P38571	399 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	MMP15	P51511	669 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	SHE	Q5VZ18	495 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	OPA3	Q9H6K4	179 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	FAM206A	Q9NX38	181 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229		R4GMQ9	66 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		21.28	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	IRGM	A1A4Y4	181 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	DCTD	P32321	178 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	MAGEB1	P43366	347 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	CCL8	P80075	99 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF525	Q8N782	197 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	ALG8	Q9BVK2	526 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229	DECR2	Q9NUI1	292 aa		21.27	■■□□□ 1
GPS1-223	ENST00000584229		J3QLW9	94 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229		J3QRE1	110 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF19	P17023	458 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	ACTA2	P62736	377 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	ACTG2	P63267	376 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	SNCB	Q16143	134 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	OR8G5	Q8NG78	346 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	SGK3	Q96BR1	496 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229		Q96MF0	132 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		21.26	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	XPNPEP2	O43895	674 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	SULT1C4	O75897	302 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	PNP	P00491	289 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV1-46	P01743	117 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	DAO	P14920	347 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	TNFSF4	P23510	183 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	PSMB10	P40306	273 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	LIPN	Q5VXI9	398 aa		21.25	■□□□□ 0.99
GPS1-223	ENST00000584229	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		21.25	■□□□□ 0.99

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