RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf44Q96CB5 159 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 RUNX2Q13950 521 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM268Q5VZI3 342 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 OXGR1Q96P68 337 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 SIGLEC11Q96RL6 698 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 FAM173AQ9BQD7 235 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 OPRM1P35372 400 aa19.34■□□□□ 0.69
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PTPRM-211ENST00000580170 PPP2CAP67775 309 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 OR2B11Q5JQS5 317 aa19.34■□□□□ 0.69
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PTPRM-211ENST00000580170 OR52B4Q8NGK2 314 aa19.34■□□□□ 0.69
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PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZNB5 142 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF687Q8N1G0 1237 aa19.34■□□□□ 0.69
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PTPRM-211ENST00000580170 CTRB2Q6GPI1 263 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 OR2AK2Q8NG84 335 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 OR52N5Q8NH56 324 aa19.33■□□□□ 0.69
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PTPRM-211ENST00000580170 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
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PTPRM-211ENST00000580170 LRP3O75074 770 aa19.33■□□□□ 0.69
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PTPRM-211ENST00000580170 OR4F5Q8NH21 305 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf40Q8WZ69 217 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 OR4F4Q96R69 305 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 C12orf10Q9HB07 376 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa19.33■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 HNF1AP20823 631 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2G1P62253 170 aa19.33■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 DEFB127Q9H1M4 99 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 SLC23A1Q9UHI7 598 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 OR2A14Q96R47 310 aa19.32■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 ARR3P36575 388 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 EPXP11678 715 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 LRRTM1Q86UE6 522 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 DMWDQ09019 674 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 KRTDAPP60985 99 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 MOGAT2Q3SYC2 334 aa19.31■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 EXD3Q8N9H8 876 aa19.31■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 AKR1C3P42330 323 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 GPR12P47775 334 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf50Q96LR7 162 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 PARD6AQ9NPB6 346 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa19.31■□□□□ 0.68
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