RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR1F12Q8NHA8 337 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF799Q96GE5 643 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1-210ENST00000574322 PGAM5Q96HS1 289 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1-210ENST00000574322 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF32P17041 273 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 HTR2CP28335 458 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 BDKRB2P30411 391 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 CAPZA1P52907 286 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 MCEMP1Q8IX19 187 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SKA3Q8IX90 412 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51D1Q8NGF3 324 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 C15orf40Q8WUR7 153 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 YIPF5Q969M3 257 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 APH1AQ96BI3 265 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM138Q9NPI0 162 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 FARS2O95363 451 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 FCGR2AP12318 317 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 POU3F4P49335 361 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPOCK1Q08629 439 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 C2orf76Q3KRA6 126 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 MZT2BQ6NZ67 158 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 PGAP1Q75T13 922 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC16A14Q7RTX9 510 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 NAA40Q86UY6 237 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZADH2Q8N4Q0 377 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR14K1Q8NGZ2 314 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMIM4Q8WVI0 70 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 NEDD4LQ96PU5 975 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2H1Q9GZK4 316 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC22A20A6NK97 555 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF587BE7ETH6 402 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 E9PLN8 166 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 AQP7O14520 342 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 LANCL1O43813 399 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP2K3P46734 347 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 INPP1P49441 399 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSG4Q00888 419 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 GLYATL3Q5SZD4 288 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD16Q6P6B7 361 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDH26Q8IXH8 852 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR52H1Q8NGJ2 320 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLSCR2Q9NRY7 297 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATPIF1Q9UII2 106 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 LYRM1O43325 122 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB3AP20336 220 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTH2RP49190 550 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 TPTEP56180 551 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF774Q6NX45 483 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 UQCC2Q9BRT2 126 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 WNT5BQ9H1J7 359 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 MGAQ8IWI9 3026 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 TGM6O95932 706 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM157BP0CG42 384 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF20P17024 532 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 GNALP38405 381 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC6A9P48067 706 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARF1P84077 181 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 DUSP18Q8NEJ0 188 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC7A6Q92536 515 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 LYZL4Q96KX0 146 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZFP3Q96NJ6 502 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SORCS2Q96PQ0 1159 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SOX7Q9BT81 388 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLEKHA1Q9HB21 404 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 V9GYS6 101 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 DSPP15924 2871 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 LDLRAD4O15165 306 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 DBHP09172 617 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDK2P24941 298 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC36A2Q495M3 483 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF554Q86TJ5 538 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTX4Q96A99 478 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 C10orf35Q96D05 121 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 NEURL2Q9BR09 285 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 PKD1L2Q7Z442 2459 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 C5orf63A6NC05 138 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 MKRN2OSH3BPM6 223 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 XRCC3O43542 346 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV3-9P01782 118 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 DGCR2P98153 550 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM69Q5SWH9 247 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 COMMD2Q86X83 199 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGFBP3Q8TAT2 258 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10A2Q9H208 303 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-210ENST00000574322 GLRX2Q9NS18 164 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms