RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	GNAL	P38405	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HTR5A	P47898	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SOX2	P48431	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PPP3R1	P63098	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		Q8N1Y9	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MPDZ	O75970	2070 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PPK0	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		M0R135	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	P2RY10	O00398	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SLC19A2	O60779	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PNP	P00491	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LCAT	P04180	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ISG15	P05161	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	COX5B	P10606	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PAX7	P23759	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CTSS	P25774	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OPRM1	P35372	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TIMP3	P35625	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TGFBR1	P36897	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CAPZA1	P52907	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RAB1A	P62820	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MALL	Q13021	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	P2RY6	Q15077	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		Q6ZT83	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DOK3	Q7L591	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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