RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555746.5

SRP54-209, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 4

Gene SRP54, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-209ENST00000555746 TMEM107Q6UX40 140 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 LRRN1Q6UXK5 716 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 C4orf22Q6V702 233 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ZNF562Q6V9R5 426 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 SCD5Q86SK9 330 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ZNF100Q8IYN0 542 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TMEM35BQ8NCS4 154 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 FBXO36Q8NEA4 188 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 OR4F17Q8NGA8 305 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 LHFPL5Q8TAF8 219 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MARCH1Q8TCQ1 289 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 GIPC3Q8TF64 312 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MAFIPQ8WZ33 124 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 AP3S1Q92572 193 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 SMARCD2Q92925 531 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 RAB3CQ96E17 227 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TCEAL4Q96EI5 215 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 COQ2Q96H96 371 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 C9orf85Q96MD7 179 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 OR5B2Q96R09 309 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 OR4F4Q96R69 305 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 COPS4Q9BT78 406 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 GSDMCQ9BYG8 508 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 BCL2L14Q9BZR8 327 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ZYG11BQ9C0D3 744 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 OR2AG1Q9H205 316 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 LPAR2Q9HBW0 351 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ESM1Q9NQ30 184 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 OR2S2Q9NQN1 319 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 GID8Q9NWU2 228 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 IMPAD1Q9NX62 359 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 GPR83Q9NYM4 423 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TAS2R9Q9NYW1 312 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 STMN3Q9NZ72 180 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PTTG3PQ9NZH4 202 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ARMCX1Q9P291 453 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 LCMT1Q9UIC8 334 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 FZR1Q9UM11 496 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 SLC22A13Q9Y226 551 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 FKBP7Q9Y680 259 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MXRA5Q9NR99 2828 aa2.55□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MKRN2OSH3BPM6 223 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PDXKO00764 312 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 EMC8O43402 210 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 OR10H3O60404 316 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 SCGNO76038 276 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TM7SF2O76062 418 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 LYPLA2O95372 231 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PLEKHA8P1O95397 391 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TSPAN12O95859 305 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 CST4P01036 141 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 IFNA16P05015 189 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 WNT2P09544 360 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 SLC35G4P0C7Q5 338 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 RD3LP0DJH9 198 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 GIMD1P0DJR0 217 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 SMIM10L1P0DMW3 83 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 NR2C1P13056 603 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ETS2P15036 469 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PVRP15151 417 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PSMC3P17980 439 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PCMT1P22061 227 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 CASP14P31944 242 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 UGT2B10P36537 528 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MAP3K8P41279 467 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 BTDP43251 543 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MAGEA3P43357 314 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 RGS6P49758 472 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PKNOX1P55347 436 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ATP5J2P56134 94 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 PAX5Q02548 391 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MGAT3Q09327 533 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ZP4Q12836 540 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 ILKQ13418 452 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 IL18R1Q13478 541 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 MED21Q13503 144 aa2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SRP54-209ENST00000555746 EXOC3L4Q17RC7 722 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms