RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 RENP00797 406 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ECH1Q13011 328 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 DGCR6Q14129 220 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SLC36A3Q495N2 470 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 LINC01006Q8NI28 216 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 NMNAT3Q96T66 252 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 PKP2Q99959 881 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SLC22A4Q9H015 551 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ARMCX1Q9P291 453 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 NME4O00746 187 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 GPR137BO60478 399 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 IGHV1-69P01742 117 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 HLA-DQA2P01906 255 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 NCK1P16333 377 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 GGT2P36268 569 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SLC7A2P52569 658 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 TPTEP56180 551 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ARF6P62330 175 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 TAF9Q16594 264 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 HDXQ7Z353 690 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 OR52J3Q8NH60 311 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 NOTCH1P46531 2555 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 OOEPA6NGQ2 149 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 CD300LBA8K4G0 201 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 NDUFA2O43678 99 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 GMDSO60547 372 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 DIRAS1O95057 198 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 IGHV4-59P01825 116 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 GYPAP02724 150 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 RHCEP18577 417 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 GSK3BP49841 420 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SEC23BQ15437 767 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 RFX4Q33E94 735 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 CGB2Q6NT52 195 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 OR4K13Q8NH42 304 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 FANK1Q8TC84 345 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 A0A0U1RQK1 487 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 GGT3PA6NGU5 568 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 M0R135 149 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 CLPXO76031 633 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 GRPP07492 148 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SLC6A6P31641 620 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 IER3P46695 156 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 KRT72Q14CN4 511 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SPTSSAQ969W0 71 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ZNF799Q96GE5 643 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 IFT27Q9BW83 186 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SIRPDQ9H106 197 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 FN3KQ9H479 309 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 A6NLC8 198 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SLC22A2O15244 555 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 COX4I1P13073 169 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ZNF823P16415 610 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 NOS3P29474 1203 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 PROK1P58294 105 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ZNF92Q03936 586 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 POU4F2Q12837 409 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 C1QL4Q86Z23 238 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 MAP6Q96JE9 813 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 OR52D1Q9H346 318 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-214ENST00000548849 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms