RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SGCZQ96LD1 299 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NPAS1Q99742 590 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CST11Q9H112 138 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NELFAQ9H3P2 528 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GAREM1Q9H706 876 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 DKKL1Q9UK85 242 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 KLK13Q9UKR3 277 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 MPDZO75970 2070 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 EML5Q05BV3 1969 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 A0A0U1RQV5 110 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 A0A1W2PNR3 127 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ARPC5O15511 151 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CA11O75493 328 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR2F2O95006 317 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 IL2RAP01589 272 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PDGFAP04085 211 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 VSIG8P0DPA2 414 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SLC25A4P12235 298 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ICAM2P13598 275 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SFTPDP35247 375 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 FOLR3P41439 243 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CLDN17P56750 224 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 H3F3AP84243 136 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ECH1Q13011 328 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 BAMBIQ13145 260 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 DHRS2Q13268 280 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR2F1Q13607 317 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF345Q14585 488 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CSRP2Q16527 193 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 LYG2Q86SG7 212 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NAA40Q86UY6 237 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 BEST3Q8N1M1 668 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GALNT16Q8N428 558 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR51E1Q8TCB6 317 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PAQR8Q8TEZ7 354 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PP6455Q8WZ26 134 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PGAM5Q96HS1 289 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PHB2Q99623 299 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CDC6Q99741 560 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PIGQQ9BRB3 760 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ARL6Q9H0F7 186 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GPR84Q9NQS5 396 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SPTBP11277 2137 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 C5orf42Q9H799 3197 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 B4E171 279 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 I3L521 148 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 M0QYG6 137 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 LMX1BO60663 402 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 STK17BO94768 372 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CFIP05156 583 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 FCER2P06734 321 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 HCKP08631 526 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PRF1P14222 555 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 LIFP15018 202 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF28P17035 718 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NAT1P18440 290 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CASRP41180 1078 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms