RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM14	Q96QK8	99 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	GABRG3	Q99928	467 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ASB7	Q9H672	318 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	AIG1	Q9NVV5	245 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CALY	Q9NYX4	217 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CD274	Q9NZQ7	290 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PIR	O00625	290 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	AGPAT2	O15120	278 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TDP2	O95551	362 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4Q2	P0C623	313 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MYL2	P10916	166 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FOLR1	P15328	257 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ATF6	P18850	670 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RFX3	P48380	749 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CRISP1	P54107	249 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	APOC4	P55056	127 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FHL5	Q5TD97	284 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MICU2	Q8IYU8	434 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	IQCK	Q8N0W5	287 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	EID2	Q8N6I1	236 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5B3	Q8NH48	314 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	GPX8	Q8TED1	209 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ARPC1A	Q92747	370 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SGK3	Q96BR1	496 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CATSPER2	Q96P56	530 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	NICN1	Q9BSH3	213 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM165	Q9HC07	324 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	IL26	Q9NPH9	171 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ASF1A	Q9Y294	204 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MED13L	Q71F56	2210 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	POLQ	O75417	2590 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ITPR3	Q14573	2671 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	FBN2	P35556	2912 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0J9YXY3	114 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFP92	A6NM28	416 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF726	A6NNF4	738 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PHOX2A	O14813	284 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZW10	O43264	779 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	MGRN1	O60291	552 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SRM	P19623	302 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CD82	P27701	267 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	AQP2	P41181	271 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC1A1	P43005	524 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CX3CR1	P49238	355 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	KDSR	Q06136	332 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52W1	Q6IF63	320 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CNIH2	Q6PI25	160 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PDIK1L	Q8N165	341 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	LIX1	Q8N485	282 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52E5	Q8NH55	327 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM159	Q96B96	161 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	GSDMA	Q96QA5	445 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	BBS2	Q9BXC9	721 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	HES7	Q9BYE0	225 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94

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