RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 MSL2Q9HCI7 577 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A17O43808 307 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 OR5L1Q8NGL2 311 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 LCN9Q8WX39 176 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PPV9 198 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 M0R3H8 397 aa5.49□□□□□ -1.53
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