RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SPDL1Q96EA4 605 aa3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM19Q96HH6 336 aa3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C3orf30Q96M34 536 aa3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SORT1Q99523 831 aa3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.59□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.59□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 NDE1Q9NXR1 346 aa3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 FLRT3Q9NZU0 649 aa3.59□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.59□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.844e-7■■■■■ 29.2
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HDAC2-216ENST00000523628 OR6N1Q8NGY5 312 aa3.58□□□□□ -1.84
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HDAC2-216ENST00000523628 RAB1CQ92928 201 aa3.58□□□□□ -1.84
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HDAC2-216ENST00000523628 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
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HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GWA3 101 aa3.57□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PPR1 153 aa3.57□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RNF212BA8MTL3 300 aa3.57□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.57□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 B4DXG7 233 aa3.57□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CLDN25C9JDP6 229 aa3.57□□□□□ -1.84
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