RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	FMO3	P31513	532 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINB5	P36952	375 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ASAH1	Q13510	395 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TFDP2	Q14188	446 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR7A5	Q15622	319 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF726P1	Q15940	193 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TAL2	Q16559	108 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RNLS	Q5VYX0	342 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	FAHD1	Q6P587	224 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM5	Q71RC9	77 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM135	Q86UB9	458 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC20B	Q86Y33	519 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RASL10A	Q92737	203 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	FGF14	Q92915	247 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	IL22RA2	Q969J5	263 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CTRC	Q99895	268 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CALN1	Q9BXU9	219 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SRR	Q9GZT4	340 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SCML1	Q9UN30	329 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	LY75	O60449	1722 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C4B	P0C0L5	1744 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0B4J2A0	478 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	FABP12	A6NFH5	140 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF726	A6NNF4	738 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNA1A	O00555	2505 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	NME4	O00746	187 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFSF11	O14788	317 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	B4GALT5	O43286	388 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZG16	O60844	167 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR8U9	P0C7N5	309 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR3A4P	P47883	348 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf80	Q0P641	193 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR8U1	Q8NH10	309 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM230	Q96A57	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF75A	Q96N20	296 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	COL21A1	Q96P44	957 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	P2RX4	Q99571	388 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CIB1	Q99828	191 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC61	Q9BV99	259 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	3.06	□□□□□ -1.92

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