RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ANOS1P23352 680 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 FGF12P61328 243 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 TSPAN31Q12999 210 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR8G1Q15617 311 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 C16orf87Q6PH81 154 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SPTSSAQ969W0 71 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 MED4Q9NPJ6 270 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 RNF7Q9UBF6 113 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 C5orf63A6NC05 138 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 TVP23AA6NH52 213 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OMGP23515 440 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZNF92Q03936 586 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SPATC1Q76KD6 591 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 DDOQ99489 341 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A4Q9H015 551 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 FAM107BQ9H098 131 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 CTSZQ9UBR2 303 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 CD300AQ9UGN4 299 aa14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 GGT3PA6NGU5 568 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 C3orf80F5H4A9 247 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ARPC2O15144 300 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 PSKH1P11801 424 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 NPY4RP50391 375 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 GPR157Q5UAW9 335 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR2T4Q8NH00 348 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 TECTBQ96PL2 329 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 CDRT15Q96T59 188 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.06□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SRRM5B3KS81 715 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 LGALS8O00214 317 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 BHLHE40O14503 412 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 GMDSO60547 372 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SFTPBP07988 381 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 BPIFB3P59826 476 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR8B8Q15620 311 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 KCNJ8Q15842 424 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 CD276Q5ZPR3 534 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 DRAM2Q6UX65 266 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 TREML4Q6UXN2 200 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SLITRK2Q9H156 845 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.05□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ADAM20O43506 726 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SNX3O60493 162 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 KRT36O76013 467 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 GRPP07492 148 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A1P11166 492 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 CFHR2P36980 270 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 PRKXP51817 358 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 LNX2Q8N448 690 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 COPS4Q9BT78 406 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.04□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 MARCH7Q9H992 704 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms