RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 MALLQ13021 153 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRN1Q6UXK5 716 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 PGAP1Q75T13 922 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 RFLNBQ8N5W9 214 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 BHLHE23Q8NDY6 225 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 HRASLS5Q96KN8 279 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 ADGRL4Q9HBW9 690 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 HAO2Q9NYQ3 351 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 INAFM1C9JVW0 142 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 PPIHO43447 177 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 H2BFMP0C1H6 154 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 SELEP16581 610 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 ROM1Q03395 351 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 ZSCAN26Q16670 478 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 LCN1P1Q5VSP4 162 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 OR10AD1Q8NGE0 317 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 OR8J1Q8NGP2 316 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 OR13G1Q8NGZ3 307 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 ITLN1Q8WWA0 313 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 CCL17Q92583 94 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 EME1Q96AY2 570 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 C9orf16Q9BUW7 83 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 EGLN1Q9GZT9 426 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 IL19Q9UHD0 177 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 LAMP5Q9UJQ1 280 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 HIVEP2P31629 2446 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC22A31A6NKX4 558 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 F5H5P2 479 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 PSMD9O00233 223 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 DLGAP1O14490 977 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 BAG2O95816 211 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 HLA-DPB1P04440 258 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 HSD11B1P28845 292 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 HTR1FP30939 366 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 CHN2P52757 468 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 RAD23AP54725 363 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 LMO4P61968 165 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM3AP98173 230 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 HFEQ30201 348 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 C6orf52Q5T4I8 152 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 AVPI1Q5T686 147 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 CYB5R2Q6BCY4 276 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM57BQ71RH2 274 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 GID4Q8IVV7 300 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 CLDND2Q8NHS1 167 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 C1orf159Q96HA4 380 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 MEGF10Q96KG7 1140 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 OR2V2Q96R30 315 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM100Q9NV29 134 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 LRP12Q9Y561 859 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-225ENST00000513069 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 TBX1O43435 398 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 APOC1P02654 83 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 SBK2P0C263 348 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 PMELP40967 661 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 MVKQ03426 396 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 MAB21L1Q13394 359 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC25A30Q5SVS4 291 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 DEGS2Q6QHC5 323 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC35F2Q8IXU6 374 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM81AQ8TBF8 368 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 HPS1Q92902 700 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 LYZL4Q96KX0 146 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 OR8B4Q96RC9 309 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 SIGLEC11Q96RL6 698 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 GCM1Q9NP62 436 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 BRD7Q9NPI1 651 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 YAE1D1Q9NRH1 226 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 AASSQ9UDR5 926 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 WIPI2Q9Y4P8 454 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 ORC6Q9Y5N6 252 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 SONP18583 2426 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 XRCC2O43543 280 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 APOL3O95236 402 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 GABRB1P18505 474 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 CA6P23280 308 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 TNFSF4P23510 183 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 GZMKP49863 264 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 RIPPLY3P57055 190 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-225ENST00000513069 CDC42P60953 191 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms