RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 TPK1Q9H3S4 243 aa11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 GGT3PA6NGU5 568 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 METTL15A6NJ78 407 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR32B1ATL7 298 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 J3QLW9 94 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 XPNPEP2O43895 674 aa11.48□□□□□ -0.57
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PGGT1B-204ENST00000503638 CD8AP01732 235 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 TACSTD2P09758 323 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 NAT2P11245 290 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF250P15622 560 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF19P17023 458 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 TUBG1P23258 451 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP5J2P56134 94 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ACTA2P62736 377 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ACTG2P63267 376 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 GLYATL3Q5SZD4 288 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 AHSA2Q719I0 299 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 LHFPL3Q86UP9 236 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 STX19Q8N4C7 294 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF540Q8NDQ6 660 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 POM121Q96HA1 1249 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ALG8Q9BVK2 526 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD60Q9BZ19 345 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 SCN3BQ9NY72 215 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB26Q9ULW5 256 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 DSCAMO60469 2012 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PTGES3LE9PB15 166 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BSA7 217 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 XRCC2O43543 280 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 MYF6P23409 242 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF85Q03923 595 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PSG7Q13046 419 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 CARTPTQ16568 116 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 MST1LQ2TV78 715 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ZMAT1Q5H9K5 638 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2T2Q6IF00 324 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF786Q8N393 782 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM80Q96HE8 168 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 REEP6Q96HR9 211 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 C4orf36Q96KX1 117 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 RHNO1Q9BSD3 238 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
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PGGT1B-204ENST00000503638 C5orf63A6NC05 138 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 SPRY3O43610 288 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 SULT1C4O75897 302 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-13P01766 116 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 RAC2P15153 192 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 SELEP16581 610 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMB10P40306 273 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PTH2RP49190 550 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 EVX1P49640 407 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF81P51508 661 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ART1P52961 327 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF92Q03936 586 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ST3GAL4Q11206 333 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 TSTQ16762 297 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ODF4Q2M2E3 257 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 OR8B12Q8NGG6 310 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 HAVCR1Q96D42 359 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 PBOV1Q9GZY1 135 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 MSL2Q9HCI7 577 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 R4GMQ9 66 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.46□□□□□ -0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 RTTNQ86VV8 2226 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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