RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502575.1

PDE4D-209, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-209ENST00000502575 ATP6V1B2P21281 511 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 RRM2P31350 389 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 LIPAP38571 399 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 RPS6KA3P51812 740 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 HILS1P60008 231 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 BTG1P62324 171 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 COX10Q12887 443 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 KRT72Q14CN4 511 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 RFX4Q33E94 735 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 FAM201AQ5SY85 155 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ARL9Q6T311 187 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 NAA40Q86UY6 237 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 HAVCR1Q96D42 359 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 CDRT15Q96T59 188 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 WACQ9BTA9 647 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 IFT27Q9BW83 186 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 VNN3Q9NY84 501 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 F5H5P2 479 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 HLA-DPB1P04440 258 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 FABP3P05413 133 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ANPEPP15144 967 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 FAHP16930 419 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 FPR3P25089 353 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 SLC6A6P31641 620 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PYCR1P32322 319 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 GGT2P36268 569 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 GSSP48637 474 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 SLC3A1Q07837 685 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 GJC3Q8NFK1 279 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ST7LQ8TDW4 575 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PTP4A1Q93096 173 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 COQ7Q99807 217 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 IL19Q9UHD0 177 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 A0A0A6YYJ9 748 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 TVP23AA6NH52 213 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 F5H5K5 113 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 TMEM178BH3BS89 294 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 J3QLI3 93 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ARPC3O15145 178 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 GMNNO75496 209 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 RENP00797 406 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ACSM4P0C7M7 580 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 TNFSF4P23510 183 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 CRABP1P29762 137 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 PMELP40967 661 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 SLC6A9P48067 706 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 GNGT1P63211 74 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ACTG1P63261 375 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-209ENST00000502575 OR8G5Q8NG78 346 aa7.29□□□□□ -1.24
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