RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLK3	Q9H4B4	646 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OSER1	Q9NX31	292 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BRB1	525 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		J3QR89	54 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRG1	P02750	347 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1S	P09871	688 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYBA2	P53672	197 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM33	P57088	247 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2V1	Q13404	147 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IER5L	Q5T953	404 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GRHL3	Q8TE85	626 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	VOPP1	Q96AW1	172 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSF4	Q9ULV5	492 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAF1	P21675	1872 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM212	A6NML5	194 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NHLH1	Q02575	133 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	VWA1	Q6PCB0	445 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GBF1	Q92538	1859 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FITM1	A5D6W6	292 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFP92	A6NM28	416 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEBPE	Q15744	281 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB30	Q15771	203 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4A47	Q6IF82	309 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIFA	Q96CG3	184 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10C1	Q96KK4	312 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CAPN10	Q9HC96	672 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFSF4	P23510	183 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	BRS3	P32247	399 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTDAP	P60985	99 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPOCK1	Q08629	439 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBLN7	Q53RD9	439 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP21	Q8N119	569 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM123	Q8N131	208 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MOB3A	Q96BX8	217 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPER1	Q99527	375 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q9N2K0	584 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GNG13	Q9P2W3	67 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FUT9	Q9Y231	359 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF264	O43296	627 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFPL1	O95159	310 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	REN	P00797	406 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-H	P01893	362 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTSA	P10619	480 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZBTB25	P24278	435 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GRK6	P43250	576 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8NFD4	153 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	BORCS7	Q96B45	105 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	RASD2	Q96D21	266 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6C6	A6NF89	314 aa		7.38	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms